دینامیک بازبرنامه ریزی متیلاسیون DNA بوسیله دوز کروموزوم X در سلول های بنیادی پرتوان القایی تحت تاثیر قرار می گیرد

تاریخ انتشار: شنبه 17 آذر 1397 | امتیاز: Article Rating

این که چگونه اپی ژنوم یک نوع سلول طی بازبرنامه ریزی به نوع غیر مرتبط دیگری از سلول ها باز آرایی می شود نامشخص باقی مانده است. بیش بیان فاکتورهای رونویسی در سلول های سوماتیک القای سلول های بنیادی پرتوان القایی(iPSCs) را مقدور می سازد. این فرایند شامل بازآرایی وسیع ژنومی متیلاسیون DNA، کروماتین و رونویسی است. کارهای اخیر نشان می دهد که شمار کروموزوم X فعا موجود در سلول روی باز آزایی متیلاسیون DNA طی بازبرنامه ریزی سلول سوماتیک به iPSCهای موشی اثر می گذارد. iPSCهای مشتق از جنس ماده با داشتن دو کروموزوم X‌فعال، هیپو متیلاسیون کلی DNA را نشان می دهند، در حالی که iPSCهای XY‌مردان، سطح متیلاسیون DNA مشابه با سلول های سوماتیکی را نشان می دهند که از آن ها مشتق شده اند. پاکسازی متیلاسیون کلی DNA در iPSCهای زنان به طور گسترده در ژنوم رخ می دهد و شامل سرکوب متیل ترانسفرازهای DNA است. با این حال، با از دست رفتن یک کروموزوم X، iPSCهای زنان نیازمند یک متیلاسیون DNA گسترده شبیه با XY iPSCها است. بنابراین، این دوز کروموزوم X است که سطح کلی متیلاسیون DNA را در iPSCها نشان می دهد. در این جا، ما شواهدی را بحث می کنیم که دوز کروموزوم X را با تنظیم متیلاسیون DNA در سلول های بنیادی پرتوان مورد بحث قرار می دهد. ما روی مطالعات بازبرنامه ریزی iPSCها فوکوس می کنیم، جایی که وضعیت کروموزوم X یک فاکتور جدید و تاثیر گذار روی درک بازآرایی های اپی ژنتیکی است.

Epigenet Insights. 2018 Oct 14;11:2516865718802931. doi: 10.1177/2516865718802931. eCollection 2018.

Dynamics of DNA Methylation Reprogramming Influenced by X Chromosome Dosage in Induced Pluripotent Stem Cells.

Janiszewski A1, Song J1, Vanheer L1, De Geest N1, Pasque V1.

Abstract

How the epigenome of one cell type is remodeled during reprogramming into another unrelated type of cell remains unclear. Overexpression of transcription factors in somatic cells enables the induction of induced pluripotent stem cells (iPSCs). This process entails genome-wide remodeling of DNA methylation, chromatin, and transcription. Recent work suggests that the number of active X chromosomes present in a cell influences remodeling of DNA methylation during somatic cell reprogramming to mouse iPSCs. Female iPSCs with 2 active X chromosomes display global DNA hypomethylation, whereas male XY iPSCs show DNA methylation levels similar to the somatic cells they are derived from. Global DNA methylation erasure in female iPSCs takes place genome-wide and involves repression of DNA methyltransferases. However, on loss of one X chromosome, female iPSCs acquire a DNA methylation landscape resembling that of XY iPSCs. Therefore, it is the X chromosome dosage that dictates global DNA methylation levels in iPSCs. Here, we discuss the evidence that links X chromosome dosage with the regulation of DNA methylation in pluripotent stem cells. We focus on iPSCs reprogramming studies, where X chromosome status is a novel factor impacting our understanding of epigenetic remodeling.

KEYWORDS:

DNA methylation; Induced pluripotent stem cells (iPSCs); X chromosome inactivation; epigenetics; reprogramming

PMID: 30443643
ثبت امتیاز
نظرات
در حال حاضر هیچ نظری ثبت نشده است. شما می توانید اولین نفری باشید که نظر می دهید.
ارسال نظر جدید

تصویر امنیتی
کد امنیتی را وارد نمایید:

آرشیو سالانه
آرشیو سالانه
نظرات خوانندگان
نظرات خوانندگان