به گزارش بنیان به نقل ازnature method، ارزیابی های اپی ژنومی نیازمند ترسیم برهمکنش های DNA با یک پروتئین خاص در سرتاسر ژنوم است. این شناخت های اپی ژنومی به طور بالقوه ای به پزشکان اجازه می دهد که درمان خصوصی را برای برخی از بیماری ها و بیماران ایجاد کنند زیرا این روند به آن ها کمک می کند که دریابند که بیمار در چه مرحله ای قرار دارد، گام بعدی را پیش بینی کنند و استراتژی درمانی مناسبی را به کار گیرند. با این حال برخی از تست ها نیازمند مقادیر زیاد سلول هستند. در یک نگاه، مطالعه برهمکنش های وسیع DNA- پروتئین و مدیفیکاسیون های کروماتین نیازمند بیش از ده میلیون سلول  برای تنها یک تست است و این امر برخی از تست ها را با مشکل مواجه می کند. بیش از یک دهه است که محققین در مرکز مهندسی مواد ویرجینیا روی ابزاری کار می کنند که بتواند به طور موثرتری سلو لها زنده را با هدف درک و دستیابی به اطلاعات بیشتر مورد آنالیز قرار دهد. آنها دستگاه میکروفلوئیدک کوچکی را با اندازه های میکرومتری ایجاد کرده اند که وقایع مولکولی درون سلولی را مورد ارزیابی قرار می دهد. در این مطالعه محققین نشان داده اند که تکنیکی به نام MOWChIP-Seq اجازه آنالیز مدیفیکاسیون های شیمیایی را با استفاده از تنها صد سلول می دهد. استفاده از این چیپ به محققین اجازه می دهد که اجزای کروماتین را با کارایی بالاتری جمع آوری کنند. در این تکنیک، به طور همزمان شست و شوهای موثری صورت می گیرد که مولکول های ناخواسته و خورده مواد و سلول را حذف می کند و موجب تخلیص مولکول های جمع اوری شده می شود. استفاده از این دستگاه و انجام کل فرایند 90 دقیقه طول می کشد. آن ها از این تکنولوژی برای مطالعه اپی ژنوم سلول های بنیادی و پیش ساز خون ساز جداسازی شده از کبد جنینی موش استفاده کردند. اطلاعات اندکی در مورد دینامیک اپی ژنوم طی خونسازی جنینی وجود دارد که به دلیل مشکلاتی بود که در جداسازی تعداد کافی سلول ها از جنین های در حال تکوین وجود دارد. این تکنولوژی جدید به خوبی این مشکل را حل می کند. این تکنولوژی همان طور که گفته شد راه را برای مطالعه اپی ژنوم با تعداد بسیار اندک سلول فراهم می کند.

پایان مطلب/